中国科学院沈阳应用生态研究所成立于1954年,是以林业、农业、环境科学为基础的综合性应用生态学研究机构。现有森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程3个研究中心、1个国家工程实验室、1个国家地方联合工程实验室、2个中科院重点实验室、1个中科院工程实验室和5个省级重点实验室。在不同地带、不同类型地区设有8个野外站,其中吉林长白山森林生态系统国家野外科学观测研究站、辽宁沈阳农田生态系统国家野外科学观测研究站、湖南会同森林生态系统国家野外科学观测研究站、清原森林生态系统观测研究站为国家级野外台站、中国生态系统研究网络(CERN)站,乌兰敖都荒漠化试验站为国家林草局荒漠化防治监测站,大青沟沙地生态研究站、沈阳树木园(沈阳城市站)和额尔古纳森林草原过渡带生态系统研究站为所级站;同时,沈阳生态所还与国家林草局共建了长白山西坡站和额尔古纳湿地站,经国家林草局批复建设了城市生态站。此外,沈阳生态所还拥有东北地区最大的生物标本馆。
研究所面向国家生态文明建设的重大战略需求——以碳达峰碳中和、黑土地保护、国家生态安全等为研究目标,针对现代农林业可持续发展和生态环境建设中亟需解决的重大科技问题,瞄准国际应用生态学发展前沿,在森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程领域开展基础性、战略性和前瞻性研究。完善和创新应用生态学理论、方法和技术体系;聚焦退化生态系统恢复-重建与生态安全、黑土地保护-利用与粮食安全、污染环境治理-改善与低碳绿色发展;为东北工农业现代化和新型城镇化提供生态与环境保障,为生态文明-美丽中国建设提供科技支撑。